由于温度、湿度、雨量、光照等气候条件会对寄生虫及其中间宿主和媒介节肢动物种群数量的消长产生影响,寄生虫病的流行往往呈现出明显的季节性。如温暖、潮湿的条件有利于钩虫卵及钩蚴在外界的发育,因此钩虫感染多见于春、夏季节;疟疾和黑热病的传播需要媒介按蚊和白蛉,因此黑热病和疟疾的传播和感染季节与其媒介节肢动物出现的季节一致。人群的生产和生活活动也会造成感染的季节性,如血吸虫病, 常因农业生产或下水活动而接触疫水,因此,急性血吸虫病往往发生在夏季。
有些人体寄生虫病可以在人和动物之间自然地传播,在人迹罕到的原始森林或荒漠地区,这些人兽共患寄生虫病可在脊椎动物之间互相传播,人进入该地区后,这些寄生虫病则可从脊椎动物传播给人,这种地区称为自然疫源地,这类不需要人的参与而存在于自然界的人兽共患寄生虫病则具有明显的自然疫源性。